Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms