Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB6Q9NP58 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB6Q9NP58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms