Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC62

SENP2, Sentrin-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP2Q9HC62 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP2Q9HC62 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP2Q9HC62 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms