Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY9Q9HBG7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms