Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELP3Q9H9T3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms