Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF408Q9H9D4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF408Q9H9D4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms