Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC4Q9H6D8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms