Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHX3Q9H6B9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms