Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EHD4Q9H223 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD4Q9H223 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms