Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIL1Q9H173 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIL1Q9H173 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms