Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms