Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms