Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CEP44Q9C0F1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms