Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms