Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCO2Q9BYV7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCO2Q9BYV7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms