Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLDIP3Q9BY77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLDIP3Q9BY77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms