Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABARAPL3Q9BY60 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms