Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC8Q9BY41 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms