Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REPIN1Q9BWE0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REPIN1Q9BWE0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms