Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms