Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf88Q9BSF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms