Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDF4Q9BRK5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms