Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms