Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED1Q99966 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms