Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRG3Q99928 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms