Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYD88Q99836 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYD88Q99836 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms