Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MEIS3Q99687 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms