Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3CQ99613 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms