Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCAF11Q99590 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCAF11Q99590 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms