Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP1Q99575 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP1Q99575 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms