Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP19Q99542 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms