Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRBNQ96SW2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms