Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF607Q96SK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF607Q96SK3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms