Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF12Q96QT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHF12Q96QT6 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms