Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms