Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EP400Q96L91 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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EP400Q96L91 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
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EP400Q96L91 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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