Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCANQ96GW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms