Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BORCS6Q96GS4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms