Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDC3Q96F86 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms