Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYFIP2Q96F07 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYFIP2Q96F07 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYFIP2Q96F07 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms