Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms