Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP4CQ96CF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP4CQ96CF2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms