Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPTQ96BT3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPTQ96BT3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms