Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTSSAQ969W0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms