Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX21Q969T3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms