Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHMTQ93088 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHMTQ93088 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms