Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms