Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSPC1Q8WXF1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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