Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF31Q8WWY3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF31Q8WWY3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms