Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMO7Q8WWI1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms